1944年----11月1日,正式成立冀鲁豫边区党委领导的第十一专署医院,其为单县中心医院的前身,医院设在单县终兴镇东杨庄村老百姓家中,孙乐斌为首任院长。

1946年----2月,冀鲁豫边区十一专署改称三专署,医院改称三专署政民医院。

1949年----10月,冀鲁豫边区三、七专署政民医院合并,组建成平原省湖西专区公立人民医院。

1950年----3月,医院迁入单县城内。

1953年----8月,平原省撤销,医院划归山东省菏泽专区,改名为山东省菏泽专区第二人民医院。

1958年----9月,医院更名为单县中心医院,原单县人民医院部分人员并入单县中心医院。

1960年----3月,单县中心医院被山东省卫生厅授予“鲁西南卫生战线上一面红旗”荣誉称号。6月医院从湖西路旧院址迁至单县文化路1号现址。

1995年----4月,单县中心医院被评为三级乙等综合医院,翟熙昌院长被国家卫生部授予“全国优秀医院院长”荣誉称号。

1999年----单县中心医院被卫生部、人事部、国家医药管理部联合授予“全国卫生系统先进集体”,被山东省卫生厅授予“全省百佳医院”。

2001年----3月,单县中心医院被济宁医学院确定为“非直属附院”, 命名为“济宁医学院附属湖西医院”。

2003年----6月,按部颁标准建立单县传染病疗养院,作为全县防治“非典”的定点医院,被誉为单县“小汤山”。

2009年----赵利华院长被国家卫生部授予“全国医药卫生系统先进个人”荣誉称号。

2010年----建设的外科大楼投入使用。

2013年----门诊医技综合楼投入使用。新建造的北院区妇儿部开业运营。

2014年----6月,单县中心医院成功晋级“三级甲等医院”。

2015年----6月,单县中心医院成为“山东施尔明眼科医院视光屈光中心技术协作单位”。9月,单县中心医院成为“中国人民解放军南京总医院技术协作医院”。

2017年----10月,单县中心医院成为“上海交通大学医学院附属瑞金医院不孕不育(生殖医学)医疗联合体成员单位”。

2018年----1月,单县中心医院成为“国家神经系统疾病临床研究中心,首都医科大学附属北京天坛医院神经系统疾病专科联盟●成员单位”。

2018年----4月,单县中心医院成立“卒中中心”。

2018年----8月,单县中心医院胸痛中心通过中国基层胸痛中心认证。

2018年----11月,单县中心医院顺利通过三级甲等综合医院等级复审。

2019年----7月,单县中心医院胸痛中心正式通过中国胸痛中心(标准版)认证